UFR de Physique

Propositions de stages en laboratoire -- M2

Les offres sont actualisées en mai. Par exemple, les offres de stages pour l'année universitaire 2015-2016 seront mises en place en mai 2015, les offres de stages pour l'année universitaire 2016-2017 seront mises en place pour en mai 2016, etc.

Mesure des dynamiques moléculaires en cellule vivante par microscopie de fluorescence

  • Option Finalisée « Physicien des hopitaux » du parcours Physique Biologique et Médicale
  • Laboratoire: Laboratoire de Physique des Lasers, Atomes et Molécules (PhLAM)
  • Responsable du stage: Laurent Heliot (laurent.heliot@univ-lille1.fr, )
  • Co-responsable(s): Alessandro Furlan, Mélanie Henry, Corentin Le Nezet
  • Mots clés: Microscopie, dynamique moléculaire en cellule vivante, transcription, régulation

La régulation de la transcription est l'une des fonctions centrales qui permet à la cellule de s'adapter à son environnement . Elle est au centre des mécanismes de contrôle au cours du cycle circadien (alternance jour/nuit), avec une forte conservation au cours de l'évolution. Parmi les complexes régulant l'activité transcriptionnelle, nous avons choisi de nous focaliser sur le complexe P-TEFb (facteur positif d’élongation de la transcription). Ce complexe libère les ARN Polymérase bloquées en pause dans la région proximale des gènes d'intérêt. Ce mécanisme est aussi utilisé pour réguler les gènes lors de la réponse au stress (Heat Shock proteins). Le complexe P-TEFb comprend deux sous-unités : la cycline T1 (CT1) et la kinase cycline-dépendante, CDK9. Ce complexe existe sous deux formes, l'une active (petit complexe) et l'autre inactive (grand complexe). En utilisant les techniques de Förster Resonance Energy Transfert (FRET) et de Fluorescence Correlation Spectroscopy (FCS) nous avons décrit une partie des mécanismes d'assemblage de ce complexe. (publication en cours). A ce stade deux questions se posent : • Les petits et grands complexes P-TEFb explorent-ils le noyau à des vitesses constantes et identiques dans des espaces de confinement variables? • Quels sont les cofacteurs de P-TEFb associés au caractère fortement anomal de la diffusion du complexe ? Nous proposons dans ce projet de thèse d'aborder cette seconde question. Au cours de ce stage l'étudiant mettra en oeuvre, en cellule vivante, des techniques de spectroscopie de fluorescence (FCS/FLIM) de super résolution photonique (sptPALM). Des techniques complémentaires d'imagerie seront également misent en oeuvre pour suivre l'évolution des cellules au cours temps (NADH, biosenseurs, image de phase).