UFR de Physique

Présentation des enseignements

PBM - Spectroscopies pour le Vivant

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  • Documents

Modules

    UE non présente en Module M1
    UE présente en Module M2

Volume horaire

  • Cours : 32
  • Cours/TD : 0
  • TD : 0
  • TD/TP : 0
  • Stage : 0
  • Projet : 0
  • ATE : 0
  • TP : 16

Contenu du module

I. Spectrométrie de Masse (I. Fournier, 8H Cours + 4H TP)

a) Rappels théoriques sur la spectrométrie de masse : Bases de la MS, sources de productions d’ions (en particulier MALDI et ESI), analyseurs et élucidation structurale

b) Interprétations de spectres MS

c) Stratégies d’analyse et d’identification des biomolécules par MS (plus particulièrement stratégies d'analyses protéomiques)

d) Exemples d'applications de la MS (protéomique/lipidomique, Imagerie MS)

II. Cristallographie (C. Bompard, 8h Cours + 4H TP)

a) Rappels sur la structure des protéines, les méthodes d’analyse et les stratégies de production.



b) Cristallogénèse et symétrie cristalline

c) Détermination de structures de protéines par cristallographie des RX : théorie et méthodologie



d) Cas particulier des protéines qui ne cristallisent pas : méthodes d’analyse structurale en solution. Comparaison des résultats obtenus par les différentes approches.

e) Analyse des structures, lecture d’articles.

III. Spectroscopies de vibration (IR et Raman) et électronique (UV-visible) (C. Kinowski, 8h Cours + 4H TP)

a) Spectroscopie de vibration ° Rappels sur la relation entre la structure moléculaire et les spectres ° Techniques pour les mesures par spectroscopie infrarouge (transmission, réflexion, micro, macro, pour liquides, solides, in situ cellulaire et tissue, etc). Difficultés et limitations ° Techniques pour les mesures par spectroscopie Raman (macro, micro, FT-Raman, SERS, in situ cellulaire et tissue, etc). Difficultés et limitations,

b) Spectroscopie UV-visible ° Rappels sur la structure électronique et les spectres UV-visible ° Techniques d’échantillonnage c) Exemples des études spécifiques. Choix des techniques et interprétations spectrales. Compréhension des analyses. Lecture des articles.

IV. Spectroscopie de Résonance Magnétique Nucléaire (J. Lyskawa, 8H Cours + 4h TP)

a) Principes fondamentaux de la RMN. Expériences à une impulsion (RMN 1H, RMN 13C): instrumentation, acquisition de spectres, notion de couplage, exploitation des déplacements chimiques.

b) Introduction à la RMN 2D, corrélations homonucléaires et hétéronucléaires (COSY, HMQC…).

c) Exercices de résolution de structures de molécules simples jusqu’à des molécules plus complexes telles que des molécules d’intérêt biologique.

Responsable

christophe kinowski
phlam
Adresse Mel : Christophe.Kinowski@univ-lille1.fr
Téléphone : 0320434818

Documents

Les enseignants peuvent mettre des cours et documents à disposition de leurs étudiants.

Ceux-ci sont centralisés sur la plateforme pédagogique Moodle de l'Université.

Plateforme pédagogique Moodle